Nouveau test sanguin pour les infections virales est prometteur

Nouveau test sanguin pour les infections virales est prometteur

« Le nouveau test utilise une seule goutte de sang pour révéler toute l’histoire des infections virales », rapporte The Guardian.

Chaque fois que vous êtes infecté par un virus, votre système immunitaire produit des types spécifiques d’anticorps en réponse. Ces anticorps restent dans votre corps longtemps après que l’infection a disparu. Le nouveau test, appelé VirScan, est capable d’évaluer tous ces anticorps, en construisant un «historique» immunitaire détaillé des infections virales.

Les chercheurs ont examiné la qualité du test effectué sur des échantillons de sang provenant de plus de 500 personnes d’Amérique du Nord et du Sud, d’Afrique et d’Asie.

Le test a correctement identifié la plupart des personnes avec des infections connues – bien qu’il y ait eu des cas de faux négatifs (dire qu’une infection n’était pas présente même si c’était le cas) et de faux positifs (diagnostiquer incorrectement l’infection quand il n’y en avait pas).

Le test pourrait théoriquement être étendu à d’autres types d’organismes responsables de maladies humaines, telles que les bactéries, mais cela n’a pas encore été testé. Le test devra également être mis à jour au fur et à mesure que de nouveaux virus sont découverts ou qu’ils changent.

Ce test devrait être considéré comme étant à un stade précoce, susceptible de subir d’autres développements et tests avant d’être prêt pour une utilisation plus large.

D’où vient l’histoire?

L’étude a été réalisée par des chercheurs de l’Université Harvard et d’autres centres de recherche aux États-Unis, en Europe, au Pérou, en Thaïlande et en Afrique du Sud.

Il a été financé par les Instituts nationaux américains de la santé, l’Initiative internationale sur les vaccins anti-SIDA, la Fondation Victor Daitz, l’Institut médical Howard Hughes, le programme VIHACAT et le CUTHIVAC, le Fonds de recherche thaïlandais et l’Université Chulalongkorn. Programme de professeur de recherche, NSF.

Certains des auteurs de l’étude sont répertoriés en tant qu’inventeurs sur une demande de brevet liée aux techniques utilisées dans l’étude (l’utilisation de banques de présentation de phages de bacteriophages pour détecter des anticorps antiviraux).

L’étude a été publiée dans la revue à comité de lecture, Science.

BBC News a bien couvert cette histoire et n’a pas surestimé les utilisations potentielles de la technique. Les experts cités dans l’article mettent en garde sur le fait que cette technologie peut s’avérer très utile dans la recherche, mais qu’elle n’est peut-être pas appropriée pour diagnostiquer des maladies telles que le VIH chez des patients individuels.

Le Mail Online a suggéré que le test pourrait être utilisé pour « aider les médecins à diagnostiquer les patients atteints de » maladies mystérieuses « . » Mais nous ne savons pas encore comment ce test fonctionne par rapport aux méthodes de diagnostic existantes pour les maladies virales.

Les médecins et les laboratoires de diagnostic devraient savoir que le nouveau test fonctionne aussi bien que les méthodes existantes avant d’envisager de l’utiliser à des fins de diagnostic ou à quel point il identifie les «maladies mystérieuses».

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Cette étude de laboratoire visait à développer un nouveau test sanguin qui pourrait détecter toutes les infections virales précédentes d’une personne à la fois.

Les tests existants pour les virus tendent à rechercher un virus unique spécifique et ne détectent pas d’autres infections virales. Ces tests ont tendance à être basés sur la détection du matériel génétique d’un virus dans notre sang ou sur la réaction de notre système immunitaire.

Une fois qu’une infection virale a été combattue avec succès par le corps, son matériel génétique peut ne pas être détecté, mais une «mémoire» immunitaire du virus peut durer des dizaines d’années. Cette recherche visait à développer un test pour tout virus basé sur l’examen de notre mémoire immunitaire des infections virales précédentes.

Les chercheurs espéraient que cela les aiderait à mieux étudier l’interaction entre notre système immunitaire et ces virus. On pense que cette interaction peut influencer le développement de maladies impliquant le système immunitaire, comme le diabète de type 1, et peut même aider le système immunitaire à combattre d’autres infections.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Notre système immunitaire fabrique des protéines spéciales appelées anticorps pour lutter contre les virus et autres infections. Ces anticorps agissent en «reconnaissant» et en se liant à des protéines spécifiques et à d’autres molécules de la cellule produites par le virus.

Le système immunitaire se souvient des virus auxquels il a été exposé et continue de produire des anticorps contre ceux-ci à un faible niveau, même après que le virus a été retiré du corps. Les chercheurs en ont profité pour développer leur nouveau test.

Les chercheurs ont commencé par générer près de 100 000 morceaux de protéines à partir de plus de 1 000 souches de l’ensemble des 206 espèces virales identifiées comme infectant les humains. Ils ont pu le faire en utilisant l’information génétique de ces virus, car ces séquences portent des instructions pour la fabrication de toutes les protéines du virus.

Les protéines ont été fabriquées dans des virus qui infectent typiquement des bactéries, appelées bactériophages ou seulement des phages. Ces bactériophages ont été génétiquement modifiés pour produire chacun un petit morceau de protéine d’un virus humain, et des milliers ont ensuite été placés sur une minuscule micropuce.

Les chercheurs ont ensuite prélevé des échantillons de sang auprès de 569 participants de quatre pays (États-Unis, Pérou, Thaïlande et Afrique du Sud) sur quatre continents différents. Ils ont extrait la partie du sang qui contient des anticorps (le sérum) et en ont lavé une petite quantité (moins d’un microlitre) sur la micropuce.

Lorsque les anticorps reconnaissent une protéine virale à laquelle ils ont été exposés auparavant, ils s’y lient. Cette réponse a permis aux chercheurs d’identifier les bactériophages qui avaient des anticorps liés à eux, et combien.

Ils ont ensuite évalué quelle protéine virale produisait chacun de ces bactériophages et de quels virus ils provenaient. Ce sont les virus auxquels la personne aurait été exposée par le passé.

Les chercheurs ont particulièrement recherché des cas où les anticorps de la personne ont reconnu plus d’un morceau de protéine d’un virus donné, car cela donnerait une plus grande confiance que la personne a vraiment été exposée à ce virus. Ils ont également développé des moyens d’aider à distinguer les réactions d’anticorps des virus apparentés qui produisent des protéines similaires.

Ils ont ensuite comparé les virus auxquels les gens de différents pays avaient été exposés. Certains des participants avaient connu des infections virales, telles que le VIH ou l’hépatite, les chercheurs ont donc vérifié dans quelle mesure ce test les avait détectés.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont découvert que le test VirScan était capable de détecter 95% ou plus des infections connues avec le VIH ou l’hépatite C qui avaient déjà été diagnostiquées avec des tests de virus uniques existants.

VirScan a également été en mesure de différencier correctement les différentes formes du virus de l’hépatite C chez 69% des personnes ayant des infections connues. Des résultats similaires ont été trouvés pour sa capacité à détecter et à différencier entre les virus de l’herpès simplex similaires (HSV1 et HSV2).

Les chercheurs ont trouvé que les participants avaient des anticorps contre une moyenne de 10 espèces virales. Les participants plus jeunes avaient tendance à avoir moins d’expositions virales que les participants plus âgés du même pays.

C’est ce qui serait attendu, car ils ont eu moins de temps pour être exposés. Le profil des différentes infections observées chez les participants de différents pays était également similaire à ce qui était attendu.

Les chercheurs ont découvert qu’il y avait des morceaux de protéines virales que les personnes qui avaient été exposées à ce virus produisaient presque toujours des anticorps. Ceci suggère que ces morceaux de protéine sont particulièrement bons pour provoquer une réponse immunitaire similaire chez différentes personnes et pourraient donc être utiles dans la fabrication de vaccins.

Les chercheurs ont également trouvé des «faux positifs» où leur test semblait détecter des morceaux de protéines virales en raison de leur similitude avec les protéines des bactéries.

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs ont conclu que le test VirScan fournit un moyen d’étudier toutes les infections virales actuelles et passées chez les personnes utilisant un petit échantillon de sang. La méthode peut être réalisée dans des échantillons provenant d’un grand nombre de personnes en même temps et est capable de distinguer les virus apparentés.

Ils ont dit: « VirScan peut s’avérer être un outil important pour découvrir l’effet des interactions hôte-virome sur la santé humaine et la maladie, et pourrait facilement être étendu pour inclure de nouveaux virus comme ils sont découverts, ainsi que d’autres pathogènes humains, tels que les bactéries, les champignons et les protozoaires [des micro-organismes unicellulaires qui causent des maladies comme le paludisme]. « 

Conclusion

Cette recherche a mis au point un test qui permet d’identifier les infections virales passées en utilisant un petit échantillon de sang, donnant un aperçu des antécédents d’infections virales d’une personne. Le test pourrait théoriquement être étendu à d’autres types d’organismes responsables de maladies humaines, telles que les bactéries.

Cependant, aucun test n’est parfait, et il y a eu des cas où une infection connue n’a pas été identifiée (faux négatif) et où une infection a été détectée qui n’était pas vraiment survenue (faux positif). Le test détecte les anticorps générés en réponse à des virus à la suite de la vaccination.

La réponse des anticorps diminue également avec le temps, de sorte que le test peut ne pas être capable d’identifier toutes les infections antérieures. Les chercheurs ont pensé que c’était la raison pour laquelle ils ont détecté moins d’exposition à certaines infections virales courantes, comme la grippe, que ce à quoi ils s’attendaient.

L’utilisation de morceaux de protéines plus courts peut également signifier que certains anticorps qui reconnaissent de plus grandes sections de la protéine, ou reconnaissent seulement la protéine après que d’autres molécules y ont été ajoutées, peuvent ne pas être identifiés.

Alors que le test semblait prometteur pour distinguer différentes souches virales apparentées, les chercheurs notent que ce test ne sera pas aussi efficace que certains tests génétiques.

Le test ne coûte potentiellement que 25 $ par échantillon, mais on ne sait pas si cela inclut le coût de toutes les machines nécessaires pour effectuer les tests. Tous les laboratoires de diagnostic n’ont pas nécessairement accès à ces machines.

Ce test devrait être considéré comme étant à un stade précoce. Alors qu’il pourrait être capable de couvrir d’autres organismes, cela n’a pas encore été testé. Les chercheurs suggèrent qu’il pourrait éventuellement être utilisé comme un premier criblage rapide des infections virales, ce qui pourrait être suivi par des tests de diagnostic plus spécifiques. Encore une fois, plus de recherche sera nécessaire pour tester cela.

VirScan devra également être mis à jour au fur et à mesure que de nouveaux virus sont découverts ou que les virus changent. Pour l’instant, il est susceptible d’être développé et largement utilisé comme un outil de recherche, plutôt que pour le diagnostic de la maladie.